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西南大學(xué)研制出首款油菜液相育種芯片

隨著分子設(shè)計(jì)育種成為引領(lǐng)作物遺傳改良的前沿技術(shù),近年來(lái)育種芯片的研發(fā)成為種質(zhì)資源創(chuàng)新的重要賽道。記者近日從西南大學(xué)獲悉,該??蒲袌F(tuán)隊(duì)歷時(shí)8年研發(fā)出首款油菜液相育種芯片,有助于實(shí)現(xiàn)油菜精準(zhǔn)育種、提高育種效率。相關(guān)研究成果已在學(xué)術(shù)期刊《作物學(xué)報(bào)》發(fā)表。
圖為油菜液相育種芯片。(受訪者供圖)
“一堆種子擺在面前,哪種長(zhǎng)出來(lái)的植株更高?哪種產(chǎn)量高?哪種不容易生病蟲(chóng)害?這些信息在育種芯片里都能找到答案?!闭撐耐ㄓ嵶髡摺⑽髂洗髮W(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院教授盧坤介紹,育種芯片是生物物種基因檢測(cè)的重要工具,在畜禽和農(nóng)作物遺傳改良與育種研究中發(fā)揮著重要作用。研究人員通過(guò)育種芯片可了解這類種子的大部分特性,從而指導(dǎo)品種培育工作。目前育種芯片在小麥和玉米等農(nóng)作物中應(yīng)用較為廣泛,但在油菜上的相關(guān)研究和應(yīng)用則較少,且主要依靠固相育種芯片來(lái)提供檢測(cè)數(shù)據(jù)。
2014年起,盧坤帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊(duì)選取了588份有代表性的油菜品種進(jìn)行全基因組重測(cè)序,并從挖掘的500多萬(wàn)個(gè)變異位點(diǎn)中篩選出5萬(wàn)多個(gè)位點(diǎn),設(shè)計(jì)了首款液相育種芯片。驗(yàn)證顯示,液相育種芯片能夠針對(duì)同一個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多次檢測(cè),準(zhǔn)確性相比傳統(tǒng)的固相芯片更高,成本則僅為后者的十分之一到五分之一,能夠更好地為油菜靶向捕獲測(cè)序、遺傳分析和基因組育種提供基因組學(xué)資源。
“這項(xiàng)研究成果對(duì)開(kāi)展油菜基因組設(shè)計(jì)育種、提高我國(guó)油菜生物育種水平具有重要意義。”中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)植物與基因組專業(yè)委員會(huì)委員李加納認(rèn)為,液相芯片的使用為開(kāi)展基因組設(shè)計(jì)育種工作打下基礎(chǔ),還可以利用育種芯片對(duì)品種進(jìn)行監(jiān)測(cè),有助于提高育種效率,設(shè)計(jì)培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的油菜新品種。(記者柯高陽(yáng))
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